İş imkanlarının olmayışı sebebiyle diyar-ı gurbet eden bir babanın oğlu olarak 1966 yılı Kiraz ayında İstanbul'da doğan Gökay Aygün, İstanbul Kağıthane İstiklal İlkokulu ve Şişli Okmeydanı Ortaokulu'nu bitirdikten sonra Beyoğlu Atatürk Erkek Lisesi'nden mezun oldu.
Hayalindeki meslek olan gazetecilik okumak için girdiği 1983 yılında üniversite sınavlarında kazandığı Marmara Üniversitesi İletişim Fakültesi Gazetecilik ve Halkla İlişkiler Bölümü'nden mezun oldu. 1988 yılında Tuzla Piyade Okulu'ndan asteğmen rütbesiyle Kuzey Kıbrıs Türk Cumhuriyeti'nde Kıbrıs'ın ilk Türk birliği olan Kıbrıs Türk Kuvvetleri Alayı'nda vatani görevini eda eden Aygün, askerlik dönüşü Yıldız Teknik Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi'nde idare amirliği görevine başladı.
İçindeki gazetecilik aşkı alevlenen Gökay Aygün, devlet memuriyeti görevinden istifa ederek ulusal bir gazetede çalışmaya başladı. Gazetenin ekonomik durumunun kötüye gitmesinden dolayı başka bir ulusal gazeteye geçen Aygün, burada da altı yıllık meslek hayatından sonra, kendini geliştirmek ve yenilikler için İstanbul'da diğer büyük bir ulusal gazetede çalışmaya başladı. Halen aynı gazetede onikinci yılını geride bırakan Aygün, sarı basın kartı sahibi.
Topkapı Sarayı Kutsal Emanetler Bölümü'nden emekli müzeci Mustafa Aygün'ün iki çocuğundan biri olan Gökay Aygün, evli ve dört çocuk babası...